水文水井钻探工程包括水文地质勘探钻探工程、地下水源开发钻探工程以及地下水的防治钻探工程，主要任务是揭露勘探区的地下水，确定主要含水层的位置、数目,査明含水层与隔水层的岩性、埋藏深度及其变化规律，并通过地下水动态观测及抽水实验，获得水文地质参数，为地下水源的开发、综合利用、制定防治措施提供依据。
在钻孔结构方面，水文地质钻孔的深度较小，一般多在200~300m之间，多数情况下孔深数十米以内。但钻孔直径都较大，多在150mm以上，以便下入滤水管和抽水试验设备等。
在钻井方法上，除采用岩心钻机和转盘式钻机进行回转钻井外，在卵砾石层也常用机械冲击式钻机进行冲击钻井。
